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严重哮喘患者血小板的分子图谱( Molecular portrait of platelets from patients with severe asthma )
M Chebbo S Assou V Pantesco C Duez D Gras
引言哮喘是一种以支气管高反应性、免疫细胞浸润气道、气道重塑和黏液分泌过多为特征的慢性炎症性疾病。血小板是一种小的无核细胞,以其在止血和血栓形成中的作用而闻名。然而,它们也表现出免疫和促炎功能。很少有研究表明它们参与了哮喘的病理生理学。我们的研究目的是分析重症哮喘患者与非哮喘患者血小板的转录组学特征。方法收集5例重症哮喘患者和5例非哮喘对照组的血液标本。用免疫磁分离技术(Miltenyi Biotec)纯化血小板。用全基因组U133加2.0GeneChip Affymetrix微阵列提取总RNA并进行分析。微阵列数据采用显著性分析,采用2倍截断和假发现率(FDR<5%)进行分析。采用R软件进行主成分分析。采用Cluster和Treeview软件包进行层次聚类分析。通过独创性途径分析,对基因本体(GO)富集分析、差异表达基因的生物学过程和网络进行了分析。结果重症哮喘患者血小板分子特征与正常人有显著性差异。具体而言,重症哮喘患者血小板中存在CD9、CD36、CD164、SERPINB1、PANX1和IFITM3等炎症反应和感染相关基因的过度表达。此外,在重症哮喘患者血小板中,磷脂酶A1(PLAAT1)和亮氨酸丰富重复序列(LRRC32)等控制分子代谢和转运的因子的mRNA转录上调。相反,与细胞死亡和存活有关的几个基因(EHMT1、ABCC1、HMOX1、GSTP1、EIF3)下调。差异表达基因的功能注释揭示了Th1和Th2激活通路(CD28、IL12、TSLPR、PI3K)的异常调节,这些通路在适应性免疫中起着关键作用,从而影响哮喘的病理生理。结论:通过对重症哮喘患者和非哮喘对照组血小板的转录组分析,可以揭示其特异性的分子基础,并确定在这些研究人群中差异表达的候选基因。本研究提供了一个全面的资源,为进一步研究血小板在重症哮喘患者中的作用奠定了基础。
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