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通过大规模的系统探测，破译RNA编辑代码的原理( Deciphering the principles of the RNA editing code via large-scale systematic probing )
A Uzonyi R Nir O Shliefer N Stern-Ginossar S Schwartz
腺苷到肌苷的编辑是由ADAR1在转录组范围内的数千个位点上催化的。尽管从生理、生物工程和治疗的角度对ADAR1产生了浓厚的兴趣，但对ADAR1底物选择的规则了解甚少。在这里，我们使用了2000个合成构式的大规模系统探测来探索决定可编辑性的结构和序列上下文。我们揭示了决定A-to-I编辑的形成和传播的两个结构层，与序列无关。首先，在结构破坏的上游35个bp和下游30个bp的固定间隔内，稳健地诱导编辑。第二，编辑是在一个双链结构上的相对站点上对称引入的。我们的发现为RNA编辑提供了一个递归模型，其中一个位点的编辑所引起的结构改变以固定的周期迭代地引起另一个编辑位点的形成，作为沿着和跨越双链RNA结构的编辑传播的基础。
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