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甲基plotlib:纳米孔测序修饰核苷酸的分析( Methplotlib: analysis of modified nucleotides from nanopore sequencing )
WD Coster M Strazisar
修饰核苷酸在基因表达调控中起着至关重要的作用。在此,我们描述了methplotlib工具,这是一种用于可视化从Oxford Nanopore Technologies测序平台检测到的修饰核苷酸的工具,以及用于统计分析受试者内等位基因特异性修饰和不同受试者间差异修饰频率的附加脚本。可用性和实现:methplotlib命令行工具是用Python3编写的,与Linux、Mac OS和MS Windows 10 Subsystem for Linux兼容,并在MIT许可下发布。源代码可以在https://github.com/wdecoster/methplotlib上找到,并且可以从PyPI和BioConda安装。我们的存储库包括测试数据,并且在travis-ci.com上对该工具进行持续测试。
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