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折叠和展开的细胞色素C离子在气相复水化的分子动力学模拟( Molecular dynamics simulations of the rehydration of folded and unfolded cytochrome C ions in the vapor phase )
Y,Mao M A,Ratner M F,Jarrold
用分子动力学(MD)模拟研究了致密和未折叠的细胞色素c离子在气相中的再水合。实验研究表明，在水蒸气作用下，致密构象比展开构象吸附更多的水分子。用多达150个水分子进行的MD模拟再现了关键的实验观察，包括由水化引起的部分复性。根据计算，在水化的初始阶段，由于一个水分子更容易与几个极性基团同时相互作用（由于它们的邻近），所以在能量上更有利于致密构象的水化。质子化侧链在模拟中不是一个受欢迎的水化位点，因为它们具有“自溶剂化”壳层，水必须被打碎才能渗透。对于这两种构象，吸附的水分子主要位于表面缝隙中。
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