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温度和扩增子长度对环境DNA降解率影响的模型和模拟:一种meta分析方法( A Model and Simulation of the Influence of Temperature and Amplicon Length on Environmental DNA Degradation Rates: A Meta-Analysis Approach )
T Saito H Doi
环境DNA(eDNA)分析可以检测各种生境中的水生生物,包括珍稀和濒危物种。降解会影响eDNA的持久性,影响基于eDNA的物种分布和发生结果。以前的研究已经调查了降解率和相关的促成因素。整合来自这些研究的数据以更好地理解和合成各种环境中的eDNA降解是很重要的。我们根据28项研究中测得的DNA的eDNA降解率和相关因素,特别是水温和扩增子长度,并对数据进行Meta分析。与前人的研究结果一致,我们的结果表明水温和扩增子长度与eDNA降解速率显著相关。通过95%分位数模型模拟,我们预测了在不同水温和扩增子长度组合下的最大eDNA降解率。预测eDNA降解对于评价物种分布和诱导eDNA方法的创新(如取样、提取和分析)非常重要,特别是对于种群规模较小的稀有和濒危物种。
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