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两种典型针叶树种松和云杉体细胞胚胎发生过程中基因的定量PCR表达。( Normalizing gene expression by quantitative PCR during somatic embryogenesis in two representative conifer species: Pinus pinaster and Picea abies. )
JJD Vega-Bartol RR Santos M Sim?Es… TIME RT-PCR POLYMERASE-CHAIN-REACTION INTERNAL CONTROL GENES REAL-TIME MARITIME PINE EMBRYO DEVELOPMENT LOBLOLLY-PINE RELATIVE QUANTIFICATION PLANT EMBRYOGENESIS
在两个代表性针叶树种中,确定了适合于对不同发育阶段和萌发阶段的qPCR数据进行归一化的内控基因,认为体细胞胚胎发生无性繁殖在针叶树种中具有很大的应用潜力。定量PCR(qPCR)被广泛用于体细胞胚胎发生和胚胎萌发过程中的基因表达分析。没有一个单一的参考基因是通用的,因此系统地表征具体条件下的内源基因是准确性的基础。我们确定了合适的内控基因来标准化两个代表性针叶树种松松和云杉体细胞胚胎发生不同阶段(胚胎团增殖、胚胎成熟和萌发)获得的qPCR数据。候选基因包括针叶树中常用的内源基因、模式植物中检测过的基因、以及根据全基因组转录谱研究在胚胎发育过程中表达变化较小的基因。使用三种不同的算法来评估表达的稳定性。pinaster中伸长因子1 alpha、alpha-微管蛋白和组蛋白3的表达值和冷杉中伸长因子1 alpha、alpha-微管蛋白、腺苷激酶和CAC的表达值的几何平均值足以用于整个体细胞胚胎发生过程中的表达研究。然而,当在对单个发育阶段的样本的实验中使用其他基因组合时,获得了提高的精确度。强调了在一个或近缘物种的不同组织或发育阶段中选择参考基因的重要性,以及常用参考基因的不稳定性。
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