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合成蛋白选择配体结合亲和介导ATP水解。( A synthetic protein selected for ligand binding affinity mediates ATP hydrolysis. )
CR Simmons JM Stomel MD Mcconnell DA Smith JL Watkins JP Allen JC Chaput
原始酶是如何从原始池中产生的,在合成生物学中仍然是一个具有重要实际意义的基本问题。在这里,我们展示了一种新进化的ATP结合蛋白,仅根据其结合ATP的能力选择,当与1当量ATP结晶时,介导ATP向ADP的区域特异性水解。通过在饱和ATP条件下生长蛋白质晶体获得了对这一反应的结构洞察。最终得到的晶体结构精炼到1.8A分辨率,揭示了这种人造蛋白质以一种不寻常的弯曲构象结合ATP,这种构象与金属无关,并由一个关键的桥接水分子保持在适当的位置。利用空突变体去除这种相互作用,会产生一个以正常线形几何形状结合ATP的变体,并且不能水解ATP。生化分析,包括对溶解的蛋白质晶体进行的高分辨率质谱分析,证实反应在晶体环境中加速。这一观察表明,具有弱化学反应性的蛋白质可以从高亲和力的配体结合位点出现,并且受约束的配体结合几何结构可能有助于促进早期蛋白质酶的出现。
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