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基于深度子空间互学习的癌症亚型预测( Deep Subspace Mutual Learning for cancer subtypes prediction )
B Yang TT Xin SM Pang M Wang YJ Wang
动机。癌症亚型的准确预测在癌症诊断和治疗中具有重要意义。疾病病因复杂,存在于不同组学水平;因此,综合分析为提高我们对癌症的认识提供了一个非常有效的方法。结果。我们提出了一种新的计算框架,称为深子空间互学习(DSML)。DSML通过采用深度神经网络同时学习每个组学数据和整体多组学数据中的子空间结构,从而通过对多级、单级和局部组学数据进行聚类来促进子类型的预测。在癌症基因组图谱的三个层次的组学数据上,对五种不同的癌症进行了广泛的实验。实验分析表明,DSML比许多先进的综合方法提供了相当甚至更好的结果。可用性和实施。DSML的实现和文档可在https://github.com/polytechnicxtt/deep-subspace-mutho-learning.git上公开获得。
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