完全测序的梭状芽孢杆菌种类和近亲的进化关系

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作者：scidown 发布时间：2021-06-08 10:25:43 文章标题：

完全测序的梭状芽孢杆菌种类和近亲的进化关系( Evolutionary relationships of completely sequenced Clostridia species and close relatives )

文章作者：

Takashi Kunisawa

文章简述：

厚壁菌门中的梭状芽孢杆菌类包括一个非常不均匀的细菌组合。它们的进化关系没有很好地建立起来；随着基因组序列信息的积累，基于16S rRNA基因序列的比较研究对它们的系统发育位置进行了修订。本研究利用贝叶斯和最大似然方法对21个串联核糖体蛋白序列进行系统发育树重建。这两棵树一致地表明Halanaobiales是梭状芽孢杆菌纲中的一个深分枝目。其余的梭菌可分为10个单系群，根据梭菌分类学的研究，大部分由2-3个目和科组成。根据目前的分类学，最大似然树将Coprothermobacter proteolyticus和Thermosiderfobium narugense归入梭状芽孢杆菌类，其中这两种细菌归入Thermosiderfobiaceae科。然而，贝叶斯树将这两种细菌置于厚壁菌和放线杆菌的分界处。确定了一个在厚壁菌属物种中唯一存在的基因排列。溶蛋白共嗜热杆菌和纳鲁根热脱硫菌不具有厚壁菌的这种排列特征。在贝叶斯树和基因排列比较的基础上，建议将协嗜热蛋白水解杆菌和热脱硫菌归入厚壁菌门之外。

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