虚拟高通量筛选:SARS-CoV-2 PLPRO和3CLPRO蛋白酶潜在抑制剂( Virtual high throughput screening: Potential inhibitors for SARS-CoV-2 PLPRO and 3CLPRO proteases )

D Jade S Ayyamperumal V Tallapaneni CMJ Nanjan MJ Nanjan

这种流行病，新冠肺炎，已经在世界范围内蔓延，影响了数百万人。因此，迫切需要找到新型冠状病毒严重急性呼吸系统综合症冠状病毒-2（新型冠状病毒）的适当治疗方法，这是一种病原体。本文主要研究新型冠状病毒蛋白酶的抑制剂PLPRO和3CLPRO,它们可以控制新型冠状病毒病毒的复制和管理其生命周期。我们使用美国食品药品监督管理局(FDA)从Zinc数据库中批准的药物、Pubchem数据库中的新冠肺炎临床试验化合物、天然产物活性和物种来源(NPASS)数据库中的天然化合物以及Maybridge数据库中针对PLPRO和3CLPRO蛋白酶进行了详细的silico虚拟高通量筛选。通过对筛选结果的分析，发现5个化合物对PLPRO有抑制作用，分别为：贝森替尼、帕克替尼、麦角胺、MFCD00832476和MFCD02180753；6个化合物分别为：贝森替尼、氯法齐明、阿比维替尼、达沙布韦、MFCD00832476和亮可可碱F。在20ns MD模拟下，这些化合物稳定在蛋白酶蛋白的活性位点内。氢键形成、疏水作用和盐桥作用揭示了其稳定性。我们的研究结果还表明，所选的5个抗PLPRO的化合物和6个抗3CLPRO的化合物都能以良好的结合自由能与它们的活性位点结合。因此，这些抑制PLPRO和3CLPRO活性的化合物可能用于治疗新冠肺炎感染。

SciDown文献求助系统（解决99%问题） Public Download Elsevier ResearchGate