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用多学科方法理解三维基因组组织( Understanding 3D genome organization by multidisciplinary methods )
Ivana Jerkovic Giacomo Cavalli
了解染色质在细胞核中是如何折叠的是了解其功能的基础。尽管由于缺乏相关的方法学,三维基因组组织一直很难研究,但21世纪在染色质接触全基因组图谱绘制方面的重大技术突破和成像技术的进步,极大地提高了我们对染色体构象和核结构的理解。在这篇综述中,我们讨论了三维基因组组织分析的方法,包括基于测序的技术,如Hi-C及其衍生物、Micro-C、DamID等;以显微镜为基础的技术,如超分辨率成像与荧光原位杂交(FISH)、多重FISH、原位基因组测序和活显微镜方法;以及计算和建模方法。我们描述了最常用的技术和它们对我们目前的核结构知识的贡献,最后,我们提供了一个展望,为未来的重大发现打开可能性的未来的方法。
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