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可扩展的，多模态分析染色质可及性，基因表达和蛋白水平在单个细胞( Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells )
EP Mimitou CA Lareau KY Chen AL Zorzetto-Fernandes P Smibert
最近的技术进步使得用SCATC-SEQ（单细胞测序转座酶可及染色质）进行大规模平行染色质谱分析成为可能。在此，我们提出了ATAC的选择性抗原测序（ASAP-seq），一个工具，同时概述可获得的染色质和蛋白质水平。我们的方法将稀疏的SCAAC-SEQ数据与数百个细胞表面和细胞内蛋白标记的稳健检测和选择性捕获线粒体DNA用于克隆跟踪配对，捕获单细胞中三种不同的模式。ASAP-seq使用了一种重新利用抗体的桥接方法：为现有技术设计的寡核苷酸偶联物，该技术将蛋白质测量与单细胞RNA测序配对。与DOGMA-seq（通过测序测量转录组和表位的细胞索引）相结合，我们通过揭示自然造血分化和外周血单个核细胞刺激过程中染色质、RNA和表面蛋白的协调和明显变化，以及作为原代T细胞多重干扰的组合解码器和报告器，展示了系统多组图谱的效用，这是CITE-seq（通过测序测量转录组和表位的细胞索引）用于测量基因调控的中心教条。
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