食管癌免疫相关预后增强RNA LncRNA AC007255.1( LncRNA AC007255.1, an immune-related prognostic enhancer RNA in esophageal cancer )

Qingqing Wang Xiaoyan Yu Ningning Yang Lu Xu Yunfeng Zhou

研究背景越来越多的证据表明，增强子RNAs（eRNAs）是一组来源于活性增强子区域的长非编码RNAs（lncRNAs）,在人类癌症基因表达调控中发挥着重要作用。然而，eRNAs在食管癌ESCA中的潜在作用尚未阐明。在此，本研究旨在探讨ESCA的关键预后eRNAs。方法利用PreSTIGE算法对活性增强子区转录的LncRNAs进行分析，并预测其目的基因。根据TANRIC数据库的ESCA RNA-seq数据，确定了与总生存(OS)相关的eRNAs。计算AC007255.1表达与ESCA各种临床性状的相关性。对其共表达基因进行了功能富集分析。基于定时器数据库，我们分析了AC007255.1表达与免疫浸润水平的相关性。qRT-PCR检测AC007255.1和PRR15在ESCA和正常组织中的表达。结果共从活性增强子区转录了2695个lncRNAs。其中33例与OS显著相关。AC007255.1是关键ERNA。PRR15为AC007255.1的目的基因（相关系数r=0.936)。AC007255.1高表达者提示OS时间较差。AC007255.1的表达与病理TNM、分级、分期等临床特征密切相关。AC007255.1与紧密连接和参与免疫应答的中性粒细胞活化密切相关。AC007255.1的表达与B细胞、树突状细胞和中性粒细胞的浸润程度有关。qRT-PCR结果证实AC007255.1和PRR15在ESCA组织中均表达上调，二者呈正相关。结论我们的发现在ESCA中发现了一个新的免疫相关ERNAAC007255.1，它可能是ESCA预后的一个有希望的因素。

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