液体活组织检查的适用性，以代表来自不同肿瘤实体的肿瘤组织的突变谱( Applicability of liquid biopsies to represent the mutational profile of tumor tissue from different cancer entities )

Sandra Liebs Theresa Eder Frederick Klauschen Moritz Schütte Diana Braunholz

液体活检的分析有助于对实体癌中肿瘤异质性和克隆进化的遗传学研究。然而，不同实体的肿瘤可能释放不同数量的循环肿瘤细胞（CTCs）和游离细胞DNA（cfDNA）到血液中，这可能限制了液体活检对不同肿瘤组织的诊断潜力。晚期结直肠癌(CRC)、头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)和黑色素瘤(MEL)患者被纳入研究，代表了不同转移模式的肿瘤。cfDNA、CTCs和肿瘤组织的突变谱通过panel测序进行评估，靶向327个癌症相关基因。共对18例患者的30个组织、18个cfDNA和7个CTC样本进行了测序。CRC和MEL的组织突变谱与cfDNA的一致性最好，这可能是由于HNSCC的显著异质性（分别为63%、55%和11%）。一致性特别依赖于用于文库制备的cfDNA的数量。在高输入量（30-100 ng,N=8)的cfDNA样本中，27个组织突变中有21个（78%）被检出，而在低输入量(<30 ng,N=10)的cfDNA样本中，65个组织突变中只有4个（6%）被检出。18例患者中13例（72%）检出CTCs。然而，下游分析由于DNA质量差而受到限制，只允许从四名患者中分离出七个CTC样本进行靶向测序。只有一个CTC样本反映了各自肿瘤的突变概况。个体突变，在CTCs中检测到，但在组织中没有，表明存在罕见的亚克隆。我们的初步研究证明了CFDNA与基于CTC的突变谱相比的优越性。进一步表明CTCs可以作为检测可能与抗病有关的稀有亚克隆的额外手段。这两个发现都需要在更大的患者队列中验证。

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