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一个高质量的carcarid基因组提供了洞察甲虫基因组进化和寒冷适应( A high-quality carabid genome provides insights into beetle genome evolution and cold adaptation )
YM Weng C Francoeur C Currie D Kavanaugh S Schoville cold adaptation Coleoptera comparative genomics gene family expansion insects Spiroplasma
超多样性的鞘翅目占地球上已知物种的25%。尽管最近在下一代测序方面取得了突破，但在组装的基因组中，甲虫多样性的代表性仍然有限。最值得注意的是，地面甲虫科Carabidae包括超过40,000个已描述的物种，尚未在使用全基因组数据的比较基因组学框架中进行研究。在这里，我们生成了一个高质量的甲虫基因组组装，以检验甲虫基因组进化的新奇来源，以及与高海拔高山栖息地专门化相关的遗传变化。特别是，这一基因组资源为昆虫冷适应机制的比较分子研究提供了基础。与其他甲虫相比,riversi甲虫具有较强的基因组紧凑性,其基因组相对较小（约147 Mb）,重复元件含量和内含子长度也相应减少。然而，较小的基因组大小并不与较少的蛋白质编码基因相关，对基因家族多样性的分析表明，与细胞膜和膜运输、蛋白质磷酸化和肌肉细丝结构相关的基因显著扩展。最后，我们的基因组分析表明，这些高海拔甲虫具有内共生螺体，其代谢途径（如丙酸盐生物合成）可能与里弗斯甲虫互补，尽管它作为有益的共生体或生殖寄生虫的作用仍然模糊不清。
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