《JCM接受》于2012年11月21日在线出版。Microbiol。doi: 10.1128 / JCM。02627-12版权所有©2012，美国微生物学会。版权所有。( JCM Accepts, published online ahead of print on 21 November 2012 J. Clin. Microbiol. doi:10.1128/JCM.02627-12 Copyright © 2012, American Society for Microbiology. All Rights Reserved. )

LF Westblade RR Chamberland D Maccannell R Collins Erik Dubberke WM Dunne CAD Burnham

38艰难梭菌（艰难梭菌）是艰难梭菌感染(CDI)的病原体，是医院和社区获得性感染性腹泻的39个重要原因（1,2）。40株高毒力艰难梭菌的出现，特别是NAP1/BI/027，改变了许多医疗机构艰难梭菌感染的流行病学；导致42例患者病情严重程度和病程增加，伴随而来的是43例患者住院时间和费用的增加（1）。因此，区分NAP1/BI/027和其他44个新出现的高毒力艰难梭菌分离株的分型方法对于了解该菌的45个传播动力学可能是重要的。此外，最近已经证明，艰难梭菌诊断试验的46项分析灵敏度和特异性可能依赖于艰难梭菌C 47菌株类型（3）。此外，最近的报道表明，48种新的抗厌氧和艰难梭菌特异性抗菌药物治疗后的复发率可能与艰难梭菌菌株类型(4，5)有关；因此，对分离类型的评价可能在未来的患者管理中发挥50%的作用。因此，艰难梭菌分型可能有可能改善临床监测以外的CDI管理，特别是在医院环境中，52临床实验室和感染控制专家对在他们机构中传播的不同艰难梭菌分离物有53基线了解可能是重要的。54脉冲场凝胶电泳(PFGE)是北美55艰难梭菌分型的主要参考方法（6）。而PFGE提供了可接受的歧视权力（6）；56它确实受到一些重要的限制，特别是劳动强度、技术57专业知识、周转时间，以及控制菌株与流行病学感兴趣的58株分离株一起处理的必要性。在欧洲，艰难梭菌分型的主要方法是59 PCR核糖体分型，即PCR扩增60个16S和23S核糖体RNA基因(7，8，9)之间的基因间隔区。多年来，艰难梭菌61的流行病学研究依赖于PFGE和PCR-核苷酸分析来确定菌株相关性，最近的63项研究(6，10，11，12)也报道了多位点变量-62数串联重复序列分析(MLVA)来进行艰难梭菌分型。虽然这种方法似乎是可重复的和歧视性的，64但它确实需要使用遗传分析仪/DNA测序仪，这对许多65个实验室来说是昂贵的。66本研究的目的是开发和验证一个半自动PCR-67核苷酸分型平台，该平台将进一步降低劳动强度，允许对分离株进行实时68次分析，提供客观的下游数据分析，保持鉴别能力，并为临床环境下艰难梭菌分离株的常规台式分型提供可行的选择。就此而言

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