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两个双/四联体适配体同时结合人α-凝血酶的结构和功能分析( Structural and functional analysis of the simultaneous binding of two duplex/quadruplex aptamers to human α-thrombin )
RT A NB B AS A LV B FS A
人α-凝血酶(凝血酶)的两个外位点之间的远距离通信密切调节着蛋白-效应物的相互作用。双/四链核酸适体是一类新兴的非常有效的凝血酶结合物。其中NU172和HD22适配体分别处于外源位点I和II识别的前沿。本研究采用结构和动力学相结合的方法研究了这两种适配体的同时结合。凝血酶与NU172和HD2227mer形成的三元复合物的晶体结构提供了这些适配体与蛋白质同时结合的详细观点,为新型双价凝血酶抑制剂的设计提供了灵感。晶体结构代表了分子动力学研究的起始模型,指出了两个外位点结合的协同作用。特别是,一个适配体与其外位点的结合降低了另一个外位点的内在灵活性,后者优先假设与结合状态下观察到的构象相似,这表明有与另一个适配体相互作用的倾向。当非活性的HD2227mer与外源位点II结合时,NU172的抗凝血活性显著增加,这为两种适配体的协同作用提供了明确的证据。
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