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根际群落选择揭示了与减少根病相关的细菌( Rhizosphere community selection reveals bacteria associated with reduced root disease )
C Yin JMC Vargas DC Schlatter CH Hagerty TC Paulitz
背景技术微生物通过增加养分利用率、产生植物生长激素和保护植物免受病原体的侵害而使植物受益。然而,植物如何改变根系微生物群落在很大程度上是未知的。结果本研究采用多周期选择系统和土传真菌病原菌Rhizoctonia solani AG8(以下简称AG8)的侵染,研究了植物对根际细菌群落的影响,并招募有益微生物抑制土传真菌病原菌,促进植物生长。在温室条件下连续种植显著提高了对AG8感病的小麦品种的抗病性。因此,利用16S rRNA基因深度测序对根际土壤微生物群落进行分析,揭示了连续小麦种植组合的不同细菌群落结构。此外,由AG8侵染根际形成的细菌群落簇与未侵染根际形成的细菌群落簇明显不同。有趣的是,随着种植周期的延长,根际细菌群落与根际病害最严重的细菌群落逐渐分离。连续单培养和施用AG8增加了一些具有潜在拮抗活性的细菌属,如几丁质菌属、假单胞菌属、金杆菌属和黄杆菌属,以及一组植物促生长(PGP)和固氮微生物,如足杆菌属、变异菌属和根瘤菌属。此外,共分离到47株细菌,隶属于35种。其中11株和5株在体外分别对AG8和水稻纹枯病菌表现出拮抗活性。Janthinobacterium在体外对土传病原菌Pythium ultimum、AG8和R.oryzae表现出广泛的拮抗作用,在土壤中对AG8表现出一定的抑病活性。结论小麦连续种植和病原菌侵染可形成根际微生物群落,并特异性地积累一批有益微生物。我们的研究结果表明,土壤群落选择可能为解决与植物病害和作物生产力相关的农艺问题提供了潜力。
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