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癌症中的嵌合rna( Chimeric RNAs in cancer )
X Shi S Singh E Lin H Li
嵌合RNA是含有两个独立基因外显子的杂交转录本。嵌合RNA传统上被认为是由染色体重排引起的融合基因转录而来。这些典型的嵌合RNA被很好地表征为以癌症特有的模式表达和/或作为癌基因产物。然而，随着深度测序技术的发展，新类型的非规范嵌合RNAs被发现可以由基因间剪接产生而不产生基因组畸变。它们可以通过相邻基因间的反式剪接或顺式剪接（cis-SAGe）机制形成。非典型嵌合RNAs在正常生理中被广泛检测到，尽管有几个已被证明具有癌症特异性的表达模式。进一步的研究表明，其中一些基因在控制细胞生长和运动中起着基础作用，并且可能具有独立于亲本基因的功能。这些发现揭示了功能转录组的一个新层面，也提高了利用非规范嵌合RNA作为癌症诊断标志物和治疗靶点的可能性。在本章中，我们将概述嵌合RNAs的不同类别及其在各种癌症和正常样本中的表达。承认嵌合RNAs并不是癌症独有的，我们将讨论生物信息学和生物学方法来识别可信的癌症特异性嵌合RNAs。此外，我们将描述探索其分子加工机制和潜在功能的下游方法。深入了解肿瘤特异性嵌合RNA的生物发生机制和功能产物，将为开发新的肿瘤生物标志物和治疗靶点铺平道路。
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