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骨调节素是肥厚性心肌病的潜在遗传靶点( Osteomodulin is a Potential Genetic Target for Hypertrophic Cardiomyopathy )
W Guo W Feng X Fan J Huang C Ou M Chen
肥厚型心肌病(HCM)是最常见的遗传性心脏病之一。其特点包括心肌细胞异常肥大、微血管功能障碍、细胞间基质积聚增加。我们的目的是解开与HCM发病相关的基因,并为诊断和治疗提供一个潜在的靶点。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定关键模块。利用预测的miRNA构建miRNA-mRNA网络,筛选出最有可能的hub基因进行基因集富集分析(GSEA)。受体操作特性(ROC)曲线验证了hub基因的诊断能力。用正常成人心脏的单细胞测序(sc-RNA seq)数据进一步预测表达hub基因的细胞类型。WGCNA将基因分配到不同的模块中,发现红色模块中包含的基因与HCM病的正相关最强。2.5%的基因在DEG和hub基因之间是共同的。通过miRNA-mRNA网络,骨调节蛋白(OMD)被认为是最有潜力的中枢基因。GSEA显示OMD主要参与细胞外基质的合成,对免疫系统有一定的抑制作用。验证了OMD在HCM中的表达。ROC曲线分析表明,曲线下面积(AUC)>0.7时,OMD可将HCM与对照组区分开来。sc-RNA序列测定显示OMD主要表达于心肌成纤维细胞的后期,提示OMD可能对成纤维细胞有一定的作用,参与了HCM的发病机制。OMD有可能作为HCM的生物标志物和治疗靶点。
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