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鸽子胸肌发育过程中mirna的鉴定及表达模式分析( Identification and expression pattern analysis of miRNAs in pectoral muscle during pigeon ( Columba livia ) development )
Xun Wang Peiqi Yan Siyuan Feng Yi Luo Mingzhou Li
微小核糖核酸(miRNAs)是动物生长发育过程中的一组重要调节因子。然而,关于miRNAs在鸽子肌肉中的表达和功能知之甚少。为了鉴定参与鸽子胸肌快速发育的miRNA,并定量它们在不同年龄阶段胸肌的表达水平,我们通过对三个不同年龄阶段(1天龄、28天龄和2岁)的小RNA进行测序,在鸽子胸肌中进行了miRNA转录组分析。应用双荧光素酶报告基因分析来验证miRNA与其靶基因之间的相互作用。我们在鸽子胸肌中鉴定了304个已知的miRNA,201个保守的miRNA,和86个新的miRNAs。在鸽子发育过程中筛选出189个差异表达(DE)miRNAs。短时间序列表达挖掘器(STEM)分析表明,89个DE miRNAs显著聚集在一个逐渐减少的表达谱中,主要富含与生物合成相关的GO类别以及MAPK和TGF-β的信号通路。双荧光素酶报告基因分析表明,一个逐渐下调的miRNA(miR-20b-5p)可以直接靶向Krüppel样因子3(KLF3)基因。总之,我们的数据扩展了鸽子miRNAs的库,增强了对雏鸽快速发育机制的理解。
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