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质谱分析和细胞表面组( Mass spectrometry and the cellular surfaceome )
J Pauwels D Fijakowska S Eyckerman K Gevaert enrichment strategies LC‐MS/MS plasma membrane proteins proteomics surfaceome
外露的质膜蛋白的集合,统称为表面层,参与了多种重要的细胞过程,如细胞与周围环境的沟通和脂质双层转运的调节。通过识别和呈递抗原,表皮在免疫系统中也发挥着关键作用,其可能的故障与疾病有关。表面蛋白作为潜在的细胞标志物、疾病生物标志物和治疗药物靶点一直被探索。尽管它的重要性,但由于表面蛋白质固有的生物物理特性,对表面结构的详细研究仍然是质谱裂解蛋白质组学的主要挑战。它们从疏水膜到水介质的提取效率低,与细胞内蛋白相比,它们的丰度低,阻碍了表面蛋白的分析,因此在蛋白质组学数据集中通常表现不足。为了解决这些问题,已经开发了几种创新的分析方法。这篇综述的目的是提供一个广泛的概述表面分析的不同方法,以及各自的考虑下游质谱为基础的蛋白质组学。
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