抑癌基因与原癌基因DNA甲基化与几种组蛋白修饰的分析

杨敏 DNA甲基化 抑癌基因 原癌基因 相关性 回归

癌症的产生是一个及其复杂的过程,先前文献表明它与抑癌基因和原癌基因的突变和修饰有着密不可分的关系,本文选取抑癌基因和原癌基因的转录起始位点和转录终止位点上下游各2000bp区域作为研究对象,探讨抑癌基因与原癌基因甲基化分布在癌细胞和正常细胞的差别,结果表明抑癌基因在癌细胞比正常细胞甲基化分布高,抑癌基因甲基化分布主要是集中于转录起始位点上下游1000bp区域内,而原癌基因的甲基化分布比抑癌基因的甲基化分布广.通过对每个抑癌基因和原癌基因在转录起始位点和转录终止位点侧翼区域内的甲基化水平进行研究,找出了两个甲基化水平具有特殊分布的抑癌基因RUNX3和WTl,这两个基因的甲基化几乎都是在癌细胞中较高,在正常细胞中较低.并且发现它们都编码转录因子且所编码的转录因子执行的生物学功能相似.其次,对细胞中抑癌基因和原癌基因的甲基化分布位置进行了相关性分析,发现抑癌基因在距位置1bin到4bin时大多数位置之间呈现正相关,在距其位置2bin时的相关系数最强.在距离本身位置5bin之外,出现了很多负相关.原癌基因的位置分布则多数呈现负相关,并且相关系数较低.最后,我们对抑癌基因和原癌基因中组蛋白修饰和DNA甲基化与基因表达之间的关系做了主成分分析和因子分析,发现原癌基因的组蛋白修饰和DNA甲基化之间的相关系数较强,利用原癌基因的几种组蛋白修饰和DNA甲基化构建了多元线性回归模型来预测基因表达.

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