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亚洲黄鳝生长性状全基因组连锁图谱及QTL定位( A genome-wide linkage map and QTL mapping for growth traits of Asian rice-field eel (Monopterus albus) )
M Shi R Luo W Zhang Y Jiang XQ Xia
黄鳝(Monopterus albus)作为一种淡水水产养殖鱼类,在亚洲正显示出越来越重要的经济价值。为扩大黄鳝生产,必须加强遗传育种研究,保证鱼苗供应的数量和质量。但该物种的遗传育种研究仍处于起步阶段。本研究对其进行全基因组连锁分析,定位其生长相关基因,可能为高产育种提供指导。此外,利用该连锁图谱建立了黄鳝基因组草图的超重叠群。利用一对成虫及其199只六个月大的后代,通过全基因组重测序构建了第一个超高密度连锁图谱。全长5161 cM的共识图谱包括1603560个SNPs,分布在11522个箱中,几乎覆盖了人群中所有的重组事件。利用该图谱,可将97.91%的超重叠群定位到染色体上,与黄鳝基因组草图具有良好的共线性。根据后代的生长相关性状,在4个连锁群的18个区域共鉴定出37个数量性状位点(QTL)。这些QTL含有58个候选生长相关基因的SNPs,其中AKS1A、brpf3、plch2、creld1、fry、slc9a1、rragc、mst1r、pfkfb2和dgkb是值得关注的基因。
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