土壤，衰老和分泌物利用:Paragon变种春面包小麦根系微生物的特征( Soil, senescence and exudate utilisation: Characterisation of the Paragon var. spring bread wheat root microbiome )

SMM Prudence JT Newitt SF Worsley MC Macey MI Hutchings

传统的农业病虫害控制和作物施肥方法导致了生物多样性丧失、生物地球化学循环失调和生态系统崩溃的危机。因此，我们必须找到对生态负责的方法来控制疾病和提高作物产量。根相关微生物组可能有助于实现这一目标，因为微生物可以帮助植物抑制病害，缓解非生物胁迫，以及养分的生物有效性。应用16S rRNA基因和真菌18S rRNA基因(ITS2区）扩增子测序技术,对英国优质春面包小麦品种Triticum aestivum var.不同土壤和发育阶段的典型。这表明，所有三个群体的群落组成在隔室之间发生了显著的变化。这种转变对细菌和真菌最为明显，而我们观察到对氨氧化型古生菌占优势的古生菌群落的选择较弱。在多种土壤类型中，我们发现土壤接种物是内圈群落组成的重要驱动因素，然而在所有土壤条件下，几个细菌科被鉴定为核心富集类群。其中最丰富的是链霉菌科和伯克霍尔德菌科。此外，随着植物的衰老，这两个家族的丰度都减少了，这表明需要活植物的输入来维持它们在内球中的丰度。为了了解根际微生物利用小麦根系分泌物的情况，采用CO2 DNA稳定同位素技术对小麦根系分泌物进行了标记。这表明伯克霍尔德菌科和其他核心富集类群中的细菌类群，如假单胞菌科，能够利用根分泌物，而链霉菌科则不能。总之，这项工作提供了更好的理解小麦微生物组，包括内球群落。了解作物微生物组的形成将有助于在未来的产量提高和生物控制的生态负责的方法。

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