利用生物信息学分析鉴定子痫前期的关键环状rna /lncRNAs/miRNAs/ mrna和通路( Identification of Key circRNAs/lncRNAs/miRNAs/mRNAs and Pathways in Preeclampsia Using Bioinformatics Analysis )

S Liu X Xie H Lei B Zou L Xie MicroRNAs, Pre-Eclampsia, RNA, Long Noncoding, Pre-Eclampsia

背景本研究旨在鉴定子痫前期(PE)中CircRNAs/LncRNAs/miRNAs/mRNAs通路的显著改变，探讨其靶点关系，并确定其生物学功能。材料与方法利用RNA-seq技术和GEO数据库，获得与PE相关的circRNAs/lncRNAs/miRNAs/mRNAs的表达谱。利用R.DAVID数据库(V.6.8)中的Limma软件包进行基因集富集分析(GSEA),利用GSEA软件(V.3.0)和ggplot2软件包进行功能分类和基因之间的关联分析,并进行相应的基因本体(GO)分类。利用R可视化软件包GOPlot更好地可视化基因与所选功能类别之间的关系。利用Cytoscape软件(v.3.6.0)构建了circRNA/lncRNA-miRNA-mRNA之间的可视化网络。利用Targetscan和miRanda数据库预测circRNA/lncRNA-miRNA-mRNA之间的靶点关系。用QRT-PCR和荧光素酶报告法验证Has_Circ_0088196/LINC01492/miR-100-5P/LIF（白血病抑制因子）的表达和靶点关系。结果与正常胎盘组织相比,胎盘组织中jak-stat信号通路被激活,miR-100-5p被下调。上调的LIF、LINC01492和hsa_circ_0088196与miR-100-5p表达呈负相关,并与miR-100-5p有靶向关系。结论miR-100-5p可能抑制PE的发生,而LIF、LINC01492和hsa_circ_0088196可能通过抑制miR-100-5p而促进PE的发生。jak-stat信号通路被激活并参与PE的进展。

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