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黄花萱草染色体水平的基因组为芦丁的生物合成和秋水仙碱的缺乏提供了新的见解( The chromosome-level Hemerocallis citrina Borani genome provides new insights into the rutin biosynthesis and the lack of colchicine )
Z Qing J Liu X Yi X Liu J Zeng
黄花菜是一种重要的园艺作物，其花芽在亚洲作为一种可口的蔬菜被广泛食用。本文利用单分子测序和Hi-C技术构建了高质量的黄曲霉参考基因组。基因组组合为3.77Gb，由3183个重叠群组成，其中N50为2.09Mb，进一步聚类为11条假染色体。更大的部分(3.25Gb或86.20%）被注释为重复内容，基因组中注释了54295个蛋白质编码基因。基因组进化分析表明,黄曲霉在距今1573万年前（Mya）经历了一次全基因组复制(WGD)事件,这是导致多个直系基因多拷贝的主要因素。我们利用这个参考基因组预测了20个参与芦丁生物合成途径的基因。此外，我们的代谢组学数据显示，秋水仙碱及其前体均未在黄曲霉中存在，这对长期以来认为这种生物碱导致黄曲霉中毒的观点提出了挑战。我们的突破性研究结果进一步证实了我们的基因组发现，即黄曲霉不包含任何与秋水仙碱生物合成有关的基因。高质量的基因组为黄曲霉的遗传研究和分子育种奠定了坚实的基础。
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