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结合CRISPR/Cas9系统和发夹探针进行DNA高保真检测( High-fidelity detection of DNA combining the CRISPR/Cas9 system and hairpin probe )
M Wang D Han J Zhang R Zhang J Li
高保真度的序列测量和单核苷酸变异(SNVs)基因分型都需要能够特异、灵敏地检测DNA的方法。CRISPR(clustered regular interspaced short balindromic repeats)/CAS系统为核酸检测提供了革命性的工具。然而,目前基于CRISPR/Cas的DNA生物传感平台大多存在Cas蛋白固有的脱靶效应,并且需要预先进行扩增过程,从而影响了分析的保真度。本工作采用CRISPR/Cas9触发的发夹探针介导的生物传感方法(即CHP)直接读取原始DNA序列,同时有效中和脱靶效应,实现了高灵敏度。该技术能在分子水平上以检测限(LOD)定量DNA靶点,并能识别等位基因分数低至0.01%±0.1%的SNVs。此外,我们表明CHP系统在不需要DNA分离步骤的情况下检测血清样本中的突变是适用的。总之,CHP系统是一个灵敏、高保真度的平台,为DNA序列分析和SNVs基因分型提供了强大的工具。
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