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缺氧诱导因子-1抑制剂结合假说的分子对接和药效团模型( Molecular docking and pharmacophore models to probe binding hypothesis of inhibitors of hypoxia inducible factor-1 )
Z Rehman I Jabeen A Fahim A Bhatti P John
低氧诱导因子-1是一种异二聚体转录因子,调节细胞对低氧的反应,并参与肿瘤进展和对化疗的耐药性。HIF-1与HIF-1亚基之间的二聚化是HIF-1与DNA结合和转录活性的关键。因此,HIF-1二聚化亚基的抑制剂有可能潜在地规避HIF-1介导的化疗耐药性。在本研究中,建立了基于配体的药效团模型来确定HIF-1抑制剂的三维结合特征。所选择的药效团模型由一个氢键供体、一个氢键受体和一个疏水特征组成。所选模型被用于ChemBridge公司公开的数据库的虚拟筛选。总之,已经确定了六种可能的抗HIF-1二聚化的药物。其中包括,Hit 1(4-(4-氯苯基)-2,6-二甲基-3,5-吡啶二羧酸),3(2-[2-(2-羟基苯甲酰基)碳肼酰基]苯甲酸)和5(3-(4-甲氧基苯基)-2,4-喹啉二羧酸)烟酸衍生物,Hit 2(3-[(1-金刚氨基)磺酰基]苯甲酸),4(5-{[(2-氟苯基)氨基]磺酰基}-2-甲基苯甲酸)和6(4-({[2-(三氟甲基)苯基]磺酰基}氨基)苯甲酸)磺酰胺衍生物。此外,化合物2的金刚烷基部分与HIF-1的疏水氨基酸残基(V336,C334,E245)和二聚位点有相互作用。所鉴定的hits显示出较低到较高的M生物活性(IC50)值,因此,在进一步的结构优化之后,可能作为HIF-1二聚化的潜在抑制剂应用于癌症化疗。由Ramaswamy H.Sarma报道。
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