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一个具有卵巢癌预后价值的RGS基因家族的5个基因标记( Identification of a five-gene signature of the RGS gene family with prognostic value in ovarian cancer )
Y Hu M Zheng S Wang L Gao B Lin
G蛋白信号调节因子RGS(regulator of G protein signaling)基因家族包括G蛋白偶联受体的负调节因子,是治疗恶性肿瘤的重要药物靶点。因此,探讨RGS家族基因在卵巢癌诊断和预后预测中的价值具有重要意义。从UCSC Xena数据库下载泛癌的RNA-seq、免疫表型和干细胞指数数据,卵巢癌的癌基因组图谱(TCGA)数据和GTEx数据。在泛癌数据库中,RGS1、RGS18、RGS19、RGS13的表达水平与间质和免疫细胞评分呈正相关。RGS18高表达的癌症患者对环磷酰胺和内拉滨更敏感,而RGS19高表达的癌症患者对克拉屈滨和内拉滨更敏感。利用KM-plotter数据库分析RGS家族基因表达与卵巢癌患者总生存(OS)和无进展生存(PFS)的关系,RGS17、RGS16、RGS1、RGS8可作为卵巢癌免疫亚型的诊断生物标志物,RGS10、RGS16可作为预测本病临床分期的生物标志物。进一步,Lasso cox分析确定了五个基因的风险评分(RGS11、RGS10、RGS13、RGS4和RGS3)。多因素COX分析显示,风险评分是卵巢癌患者的独立预后因素。免疫组织化学和HPA蛋白数据库证实五基因标记在卵巢癌中过表达。GSEA显示其主要参与ECM-受体相互作用、TGF-beta信号通路、Wnt信号通路、趋化因子信号通路,促进卵巢癌的发生发展。利用RGS家族基因构建的卵巢癌预测模型对临床决策和卵巢癌患者的个性化治疗具有重要意义。
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