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蜂胶诱导孔隙形成的原因与影响:计算方法( Cause and Effect of Melittin-Induced Pore Formation: A Computational Approach )
M Manna C Mukhopadhyay Cell Membrane Chlorides Water Lipid Bilayers Phosphatidylcholines Melitten Ion Channels Protein Structure, Quaternary Substrate Specificity Dose-Response Relationship, Drug
以高肽脂比(1:30)包埋在棕榈酰油基磷脂酰胆碱双层膜上,模拟了水和离子存在下蜂毒素的包埋过程。模拟结果表明,通过结合多肽的集体微扰膜,离子透水孔开始出现。蜂毒肽带正电荷的残基不仅起到“锚”的作用,还会破坏细胞膜,导致细胞裂解。对脂尾序参量剖面的详细分析描述了局部膜微扰。水腔附近的脂质采用倾斜构象,允许局部双层变薄。由此形成的前孔可以认为是蜂毒肽诱导的双层膜结构缺陷。由于强阳离子性质,蜂毒肽诱导的前孔对阴离子的选择性高于对阳离子的选择性。当Cl(-)离子进入前孔时,它们被位于孔壁上的带正电荷的残基静电俘获。从扩散系数的计算可以看出Cl(-)离子在膜内部的受限运动。此外,局部脂质的重定向是以这样的方式发生的,即很少的脂质头和肽螺旋能够沿穿透水相的表面排列。脂质的翻转倾向于蜂毒肽诱导的圆环孔超过桶壁机制。因此,我们的结果提供了抗菌肽蜂毒素破坏膜机制的原子水平的细节。
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