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一种从海胆中分离出的能溶解琼脂和卡拉胶的细菌( Colwellia echini sp. nov., an agar- and carrageenan-solubilizing bacterium isolated from sea urchin )
L Christiansen PK Bech M Schultz-Johansen HJ Martens P Stougaard
从丹麦海胆Stornylocentrotus droebachiensis肠道中分离到一株新的细菌A3T。该菌株革兰氏反应阴性,棒状,兼性厌氧,在5-25°C(最适20°C),pH7-9(最适pH7)和1-6%(W/V)NaCl(最适3%)条件下生长。菌株A3T以琼脂、琼脂糖、κ-卡拉胶、海藻酸盐和海带多糖为唯一碳源生长。由于酶的活性,在固体平板培养基上观察到琼脂和κ-卡拉胶的完全液化。主要脂肪酸组成为特征3(C16:1ω7C和/或C16:1ω6C)和C16:0。呼吸醌类成分为泛醌Q-8(92%)和Q-7(8%),极性脂类成分为磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油和二磷脂酰甘油。DNA G+C含量为36.9mol%。基于16S rRNA基因的系统发育分析表明,该细菌隶属于γ-变形杆菌的变单胞菌科中的Colwellia属。Colwellia属中A3T菌株与其近亲(C.psychrerythraeAATCC27364T和C.asteriadiskMD002T)的16S rRNA基因序列相似性为97.5%。A3T菌株与其他Colwellia成员的平均核苷酸同源性为78.6-80.5%,DNA-DNA杂交预测显示A3T菌株与其他Colwellia物种的亲缘性小于23%。表型、系统发育和基因组分析支持了A3T菌株代表Colwellia属的一个新种的假设,其名称为Colwelliaechini sp.11月被提议。型株为A3T(=LMG30125T=NCIMB15095T)。
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