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鉴别差异表达的lncRNAs作为活动性肺结核潜在的血浆生物标志物( Identification of differentially expressed lncRNAs as potential plasma biomarkers for active tuberculosis )
Y Fang J Zhao X Wang X Wang C Yuan
背景结核病是世界范围内最致命的传染病之一，很难诊断。由于长非编码RNA（lncRNAs）被证明是有前途的生物标志物，我们的目标是在血浆中识别lncRNAs作为结核病的潜在生物标志物。方法分析GEO数据集(GSE94907),鉴定活动性结核(ATB)患者和健康对照者血清外泌体中lncRNAs的差异。为了寻找可用于结核病诊断的有希望的候选物，我们使用FPKM>5的临界值排除低丰度lncRNAs。对69例ATB患者和69例健康人的4个lncRNAs进行实时定量PCR检测。建立受试者操作特性(ROC)曲线，评价这些lncRNAs对ATB的诊断价值。结果GEO数据集和NONCODE数据库的综合分析发现ATB患者血清外泌体中有9个lncRNAs表达异常。ATB患者血浆中nonHSAT101518.2、nonHSAT067134.2、nonHSAT148822.1和nonHSAT078957.2的表达水平明显低于健康对照组。ROC曲线分析提示这4种lncRNAs能以较高的特异性和敏感性鉴别ATB与健康个体。结论在ATB患者血浆中发现了4种差异表达的lncRNAs,可作为ATB的潜在诊断标志物。
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