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高维突变体和模块热力学循环、分子开关和自由能转导( High-Dimensional Mutant and Modular Thermodynamic Cycles, Molecular Switching, and Free Energy Transduction )
Carter Jr. W Charles
了解蛋白质的不同部分如何产生协调的行为已经并将继续推动蛋白质科学和酶学的进步。然而,尽管人们对变构的概念基础达成了共识,变构机制的特殊性质阻碍了一般的研究方法。计算方法可以从结构变化中识别构象过渡态,揭示强加多态行为的常见切换机制。热力学循环使用阶乘微扰来测量分子开关侧链之间的耦合能,这些侧链在畴运动期间介导剪切。这样的循环现在已经被测量可分离域之间能量耦合的模块循环所补充。对于一个模型系统,域间的能量耦合与动态侧链间的能量耦合在数量上是等价的。结构域运动、切换残基和催化之间的联系使得三磷酸核苷的水解以结构域运动为条件,证实了自由能转导的一个基本但被忽视的方面,并暗示了这些研究的潜在普遍性。《生物物理学》第46卷年度评论的最终在线出版日期预计为2017年5月20日。订正估计数见http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates。
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