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开放染色质的双DNA和蛋白质标记揭示了白血病表观基因组景观的动态( Dual DNA and protein tagging of open chromatin unveils dynamics of epigenomic landscapes in leukemia )
JD Lee JA Paulo RR Posey V Mugoni PP Pandolfi
染色质的结构通过控制转录因子进入基因调控位点来调节真核细胞的状态。在此，我们描述了一种双转座酶-过氧化物酶的方法，整合DNA和蛋白质标记(iDAPT)，它检测与染色质可接近区域相关的DNA（iDAPT-seq）和蛋白质（iDAPT-MS）。除了直接鉴定结合的转录因子外，iDAPT还能推断它们的基因调控网络、蛋白质相互作用体和染色质可及性的调控。我们应用iDAPT来描述急性早幼粒细胞白血病粒细胞分化的表观基因组后果，产生了以前未描述的机制见解。我们的发现证明了iDAPT作为研究与生物现象和疾病相关的动态表观基因组景观及其转录因子组分的平台的力量。
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