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利用ChIRC13a-seq对RNA分布进行全基因组检测和定量( Genome-wide detection and quantitation of RNA distribution by ChIRC13a-seq )
Fan Yang Bogdan Tanasa Rudi Micheletti Kenneth A. Ohgi Michael G. Rosenfeld
真核生物的基因组被广泛地转录，但大多数转录本仍然没有功能特征。这主要归因于缺乏一种强有力的以RNA为中心的技术，该技术能够准确定量内源性RNA的假定基因组结合位点。我们在此描述了一个详细的染色质分离方案，通过RNA-Cas13a复合测序(ChIRC13A-SEQ)，基于最近发现的CRISPR-Cas13a从wadei钩体(LwaCas13a)分离染色质，以分析RNA相关的染色质结合引用。Chirc13a-Seq使用生物素化的、酶解死亡的Cas13a(dCas13a)，该Cas13a仍然能够结合靶RNA并引导针对感兴趣的RNA靶特异性的RNAs（gRNAs）来富集RNA及其染色质结合位点。该方法可在标准分子生物学实验室进行，并在制备Chirc13a-seq文库时进行二维检测。
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