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几何素描简洁总结单细胞转录组学景观:补充信息( Geometric Sketching Compactly Summarizes the Single-Cell Transcriptomic Landscape: Supplementary Information )
Brian Hie Hyunghoon Cho Benjamin DeMeo Bryan Bryson Bonnie Berger
大规模的单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究正变得越来越普遍，压倒了现有的分析管道。在这里，我们描述了如何通过使用一个小的细胞子集来总结数据集中的转录组异质性来增强和加速单细胞数据分析，我们称之为几何草图。我们的草图提供了更全面的转录多样性可视化，以高灵敏度捕捉稀有细胞类型，并通过聚类准确揭示生物细胞类型。我们的脐带血细胞草图揭示了一个罕见的炎症巨噬细胞亚群，我们在体外实验验证了这一点。我们草图的构建速度非常快，这使得我们能够加快其他关键的资源密集型任务，如scRNA-seq数据集成。我们预计，我们的算法将成为共享和分析快速增长的scRNA-seq数据时越来越重要的一步，并有助于单细胞组学的民主化。
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