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拟南芥ABA受体PYL1中raptor结合基序的建模鉴定( Modeling-based identification of a Raptor-binding motif present in Arabidopsis ABA receptor PYL1 )
J Kim D Kim CI Cheon S Kim
通过相互作用模拟的分子模拟和酵母双杂交分析,我们确定了拟南芥ABA受体PYL1蛋白的Raptor结合区。该区域是该蛋白C端alpha螺旋结构的一部分,其中FADTV序列中的一个苯丙氨酸和一个天冬氨酸被预测与猛禽形成关键的相互作用。虽然该序列与我们先前从AtS6Ks及其正交物以及AtATG13中鉴定和定义的植物TOS共识(FSD[V/I]F)有些偏差,但模型数据表明该序列及其邻近区域在结构上能够与其他含有TOS基序的结构以相同的模式建立与猛禽的相互作用。这一发现为植物TOS基序的理解提供了一个新的视角,并在此基础上提出了另一个TOS底物TAP46中的Raptor结合区。
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