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高通量测序数据挖掘发现ccRCC细胞周期通路上调基因( Up-Regulated Genes in Cell Cycle Pathway of ccRCC Discovered by High-Throughput Sequencing Data Mining )
J Liu K He J Wang N Wang
应用RNA-seq技术对肾透明细胞癌的转录组进行测序,从转录水平验证已知与肾透明细胞癌(ccRCC)相关的细胞周期基因、基因组合或途径。寻找可能影响CCRCC增殖、分化和肿瘤进展的基因组合和途径。方法:提取肾透明细胞癌及周围正常组织标本,构建ccRCC及正常肾组织cDNA文库,采用SOLID 3.0测序系统进行mRNA测序。结果:经测序和获得细胞周期相关转录组,结合基因表达水平数据软件,对已知基因相关、基因组合,或接入表达水平验证,发现ccRCC细胞周期通路中的大部分基因上调,导致细胞周期紊乱,加速细胞分裂,破坏细胞周期监测机制,最终导致癌症。结论:本研究结果将为CCRCC的诊断和治疗提供一些基础资料。
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