有机反应( Bioorganic Reactions )

GW Morrow

对许多生物合成过程至少有一个入门层次的了解，并不是必须有酶学或生物化学的背景，因此本书并不以任何重要的方式涉及酶学或酶的结构或功能，即使我们将要考察的许多化学几乎完全依赖于酶催化。然而，我们将提及酶催化和特定酶的名称，在整个文本中，我们检查生物合成过程和反应的重要细节。那么酶到底是什么呢？简单地说，酶是天然存在的蛋白质，在生命系统中催化各种生化反应。正如我们将看到的，它们催化的许多反应都是熟悉的有机反应，但有特定的目的和目标结构。一般说来，酶通过降低反应物的过渡态能量或提高基态能量来催化有机反应，其方式与实验室化学反应中的非酶催化剂基本相同，尽管在酶催化的情况下，已报道了高达1023的速率提高，远远超过目前通过常规化学手段可实现的速率提高。了解酶与底物（反应物）的相互作用形成酶-底物复合物（E-S复合物）对于了解酶是如何进行其工作的是基本的。虽然过于简单化，但酶-底物相互作用的“锁和钥匙”模型为理解酶介导反应的显著底物特异性提供了一个直观的背景。因此，所谓的酶活性位点或结合位点（“锁”）将只接受某些特定的底物结构（“键”），具有形状、构象、分子间作用力和其他决定锁与键匹配的因素。酶不仅催化特定种类的反应，它们能特异性地作用于某些化合物或类化合物或官能团，往往表现出显著的选择性和立体特异性，特别是在识别和/或引入有机分子中的手性中心方面。在命名方面，酶的名称总是以酶的后缀结尾，通常根据它们作用的底物和/或它们催化的反应过程的种类来命名。

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