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高吞吐量,ヾ赋予和估计赦免量化的血浆蛋白质组数据﹊ndependent收购/质谱(“HIAP〥IA”)( High‐throughput, inヾepth and estimated absolution quantification of plasma proteome using data﹊ndependent acquisition/ mass spectrometry ("HIAP〥IA") )
Y Zhou Z Tan P Xue Y Wang F Guan data‐independent acquisition myelodysplastic syndromes Orbitrap plasma proteomics quantitative proteomics
以质谱为基础的血浆蛋白质组学已被证明是一种有用的工具,能够在一次LC*S/MS实验中定量数百种蛋白质,用于生物标记物的发现或疾病机制的阐明。我们开发了一种新的基于数据依赖采集(DIA)/MS的工作流程,用于在不耗尽高密度蛋白质的情况下,高通量地进行血浆蛋白的EPTH和估计绝对定量(简称HIAP IA)。在HIAP IA工作流程中,我们建立了Ultra EEP累积未耗尽和耗尽谱库,其中包含55157个多肽和5328个蛋白质,优化了柱长(50 cm)和液相色谱仪器的梯度(90 min),优化了50个平均分离窗口为17 Da的DIA片段,并选择了用于估算血浆蛋白绝对定量的参考蛋白。对606个蛋白进行了三次定量,对427个蛋白进行了定量,其变异系数为6个数量级,定量限为10-20ng/ml,发现了95个差异表达蛋白,为MDS的病理生理机制提供了理论依据。这篇文章受版权保护。保留所有权利
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