绝经期泌尿生殖综合征(geniturinary syndrome of menopause,GSM)描述了雌激素缺乏对女性泌尿生殖系统(包括阴道、阴唇、尿道和膀胱)的影响所引起的体征和症状。与GSM相关的体征/症状可能发生在多种病因的任何生殖阶段,但最常见的是在绝经期,因为雌激素水平较低。阴道微生物群,特别是乳杆菌属,对女性生殖道有益;然而,它们的丰度在更年期下降。我们的目的是纵向评估阴道微生物区系特征16S rRNA基因扩增子测序和GSM相关终点跨越生殖阶段。在一项为期两年的队列研究中,750名年龄在35-60岁的妇女登记和2111次半年访视中,低乳酸杆菌阴道微生物群落在绝经前、围绝经期和绝经后妇女的访视中分别占21.2%(169/798)、22.9%(137/597)和49.7%(356/716)(P<.001)。与高Gardnerella vaginalis相对丰度和厌氧菌多样性的群落相比,以下群落与阴道萎缩的协变量调整后的赔率较低:绝经后妇女中以Crispatus为主的群落(赔率比[OR]=0.25;95%可信区间[CI],0.08,0.81)、L.gasseri/L.在围绝经期妇女中,jensenii(OR=0.21;95%CI,0.05,0.94)和L.iners(OR=0.21;95%CI,0.05,0.85),在绝经前妇女中,L.iners占优势的群落(OR=0.18;95%CI,0.04,0.76)。绝经后妇女合并L.gasseri/L.以Jensenii为主的社区阴道干涩(OR=0.36;95%CI,0.12,1.06)和性欲低下(OR=0.28;95%CI,0.10,0.74)的几率最低。尿失禁的发现不一致。阴道微生物群与GSM体征/症状的关系在绝经后最为明显,提示了治疗和预防的途径。