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小鼠雌性生殖系干细胞与STO细胞的RNA m6A和DNA甲基化特征比较( Comparison of RNA m6A and DNA methylation profiles between mouse female germline stem cells and STO cells )
X Zhao GG Tian Q Fang X Pei J Wu
N-甲基腺苷(mA)甲基化修饰是真核生物mRNAs最普遍、最丰富的内部修饰。越来越多的证据表明mRNA mA在干细胞的发育过程中起着重要的作用。然而,据我们所知,关于mRNA mA在小鼠雌性种系干细胞(mFGSCs)中的作用尚未见报道。在本研究中,我们比较了FGSCs和SIM小鼠胚胎衍生硫鸟嘌呤和哇巴因耐药(STO)细胞之间mRNA mA甲基化和DNA甲基化的全基因组图谱。qRT-PCR显示FGSCs中mRNA MA相关基因(Mettl3、Alkbh5、Ythdf1、Ythdf2、Ythdc1和Ythdc2)的表达水平明显高于STO细胞。mA RNA免疫沉淀测序(MeRIP-Seq)数据进一步表明,FGSCs和STO细胞中特有的mA甲基化mRNA分别与细胞群增殖和体细胞发育有关。此外,敲除Ythdf1抑制了FGSC的自我更新。比较FGSCs和STO细胞甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq)结果,发现DNA甲基化通过抑制体细胞程序促进FGSC增殖。提示mA调节FGSC的自我更新可能是通过mA结合蛋白YTHDF1和DNA甲基化抑制FGSC的体细胞程序来维持FGSC的特性。
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