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生物信息学分析确定了冠状动脉疾病的潜在诊断特征( Bioinformatics analysis identifies potential diagnostic signatures for coronary artery disease )
D Zhang L Guan X Li
背景冠状动脉疾病(Coronary artery disease,CAD)是世界范围内死亡的主要原因。我们的目的是筛选潜在的基因特征,并建立CAD的诊断模型。方法下载GSE66360和GSE60993两个mRNA图谱,进行差异表达、基因本体术语和京都基因与基因组百科全书(KEGG)途径分析。利用STRING数据库识别蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。应用Cytoscape软件进行PPI网络可视化和关键基因筛选。最后,建立了诊断模型。结果GSE66360共检测到2127个差异表达基因,GSE60993共检测到527个差异表达基因。在两个数据集中显示CAD患者和对照之间差异表达的153个DEG中,471个生物学过程术语,35个细胞成分术语,17个分子功能术语和49个KEGG通路显著富集。确定了PPI网络中前20个关键基因,并由5个最优基因构建了一个诊断模型,该模型可以有效地将CAD患者与对照组分离。结论本研究确定了几种潜在的冠心病生物标志物,并建立了logistic回归模型,为今后临床诊断和指导治疗策略提供了有价值的参考。
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