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来自巴基斯坦的“亚洲念珠菌”菌株的两种独特的原噬菌体( Two Unique Prophages of Candidatus Liberibacter asiaticus Strains from Pakistan )
X Cui K Liu S Atta C Zeng X Wang
亚洲假丝酵母（Candidatus Liberibacter asiaticus）是引起黄龙病(HLB，黄梢病）的病原菌，对柑橘生产具有很强的破坏性。类菌株蕴藏着预言。我们利用下一代测序(NGS)技术在巴基斯坦PA19菌株中鉴定了两个独特的预言家，分别命名为P-PA19-1和P-PA19-2。P-PA19-1在SC1(1型）的早基因区具有较高的序列相似性（同一性为78.23%)，而在晚基因区具有明显的差异（同一性为62.03%）。P-PA19-2在晚期基因区与SC2(2型）高度相似（同源性为97.96%）,在早期基因区与SC2(2型）相似，但在SC2中缺失了7179 bp的crispr/cas系统。P-PA19-1和P-PA19-2均为环状质粒，只有P-PA19-2整合在PA19染色体上。这两个新的预言只在巴基斯坦的样本中发现。预言家的鉴定提高了我们对类基因组多样性的理解，也提高了类预言家的生物学和进化。
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