对拟南芥、蓝藻和叶绿体基因组的进化分析揭示了质体系统发育和细胞核中数千个蓝藻基因

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作者：scidown 发布时间：2021-06-03 16:33:15 文章标题：

对拟南芥、蓝藻和叶绿体基因组的进化分析揭示了质体系统发育和细胞核中数千个蓝藻基因( Evolutionary analysis of Arabidopsis, cyanobacterial, and chloroplast genomes reveals plastid phylogeny and thousands of cyanobacterial genes in the nucleus )

文章作者：

W Martin T Rujan E Richly A Hansen S Cornelsen T Lins D Leister B Stoebe M Hasegawa D Penny Evolution

文章简述：

叶绿体曾经是成为内共生体的自生蓝藻,但当代质体的基因组编码的基因仅为其自生表亲的约5-10%,表明在植物进化过程中,许多基因不是从质体中丢失,就是转移到细胞核。以前的估计表明，拟南芥基因组中可能有800到2000个基因来自蓝藻，但缺乏能够提供这一数字的直接估计的全基因组系统发育调查。我们比较了拟南芥基因组中编码的24,990个蛋白质与来自三种蓝藻基因组、16种其他原核生物参考基因组和酵母的蛋白质。在9368个拟南芥蛋白中,866个蛋白只在蓝藻中检测到同源物,834个蛋白在系统发育树中与蓝藻同源物分支。将这些保守的蛋白质外推到全基因组，数据表明约4500个拟南芥蛋白质编码基因（约占总基因数的18%）是从质体的蓝藻祖先获得的。这些蛋白质包含所有功能类，其中大多数是针对叶绿体以外的细胞隔室。对15个测序的叶绿体基因组的分析揭示了117个核编码蛋白，这些蛋白也仍然存在于至少一个叶绿体基因组中。从41个蛋白质和8303个氨基酸位点推断的叶绿体基因组系统发育表明，红藻中至少发生了两次独立的次生内共生事件，叶绿体蛋白质中氨基酸组成的偏倚强烈影响质体基因组系统发育。

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