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前列腺癌全基因组关联研究在多个人群中的通用性( Generalizability of associations from prostate cancer genome-wide association studies in multiple populations. )
KM Waters ML Le LN Kolonel KR Monroe DO Stram BE Henderson CA Haiman ethnic groups ethnicity genes genetic factors genetic variation genomes human diseases men molecular genetics neoplasms
全基因组关联研究已经确定了欧洲血统人群中与前列腺癌风险相关的多个常见等位基因。需要在其他人群中测试这些变异,以评估这些关联的普遍性,并可能指导精细绘图工作。我们在2768例前列腺癌病例的多种族样本和2359例多种族队列(非洲裔美国人、欧洲裔美国人、拉丁美洲人、日裔美国人和夏威夷土著人)的对照中检查了其中的13个风险变异。我们用logistic回归估计了种族特异性和集合优势比,并检验了效果的种族异质性。在种族集合分析中,13个变异中有12个与风险呈正相关,其中6个变异具有显著的统计学意义(P<0.05):JAZF1,rs10486567[优势比(OR),1.23;95%可信区间(95%CI,1.12-1.35);XP11.2,rs5945572(OR,1.31;95%CI,1.13-1.51);HNF1B,rs4430796(OR,1.15;95%CI,1.06-1.25);MSMB,rs10993994(OR,1.13;95%CI,1.04-1.23);11q13.2,rs7931342(OR,1.13;95%CI,1.03-1.23);3P12.1,rs2660753(OR,1.11;95%CI,1.01-1.21);SLC22A3,rs9364554(OR,1.10;95%CI,1.00-1.21);CTBP2,rs12769019(OR,1.11;95%CI,0.99-1.25);HNF1B,rs11649743(OR,1.10;95%CI,0.99-1.22);EHBP1,rs721048(OR,1.08;95%CI,0.94-1.25);KLK2/3,rs2735839(OR,1.06;95%CI,0.97-1.16);17q24.3,rs1859962(OR,1.04;95%CI,0.96-1.13);LMTK2,rs6465657(OR,0.99;95%CI,0.89-1.09)。四个变异体(EHBP1,P(het)=3.9×10(-3);11q13,P(het)=0.023;HNF1B(rs4430796),P(het)=0.026;和KLK2/3,P(het)=2.0×10(-3))的效应具有显著的种族异质性。尽管由于样本量和等位基因频率的差异,在一些族裔/种族群体中的能力有限,但这些发现表明,在欧洲血统人群中识别的前列腺癌变异体中,很大一部分是风险的全球标记。对于其中许多地区,在非欧洲样本中的精细定位可能有助于定位因果等位基因,并更好地确定它们对人群前列腺癌风险的贡献。
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