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垂体神经内分泌肿瘤的单细胞转录组和基因组分析( Single-cell transcriptome and genome analyses of pituitary neuroendocrine tumors )
Yueli Cui Chao Li Zhenhuan Jiang Shu Zhang Dabiao Zhou
背景垂体神经内分泌肿瘤(Pituitary neuroendocrine tumors,PitNETs)是颅内第二大常见肿瘤。我们对这些肿瘤的发病机制和异质性缺乏全面的了解。方法对21例PitNETs主要亚型的23例手术切除标本中的2679个细胞进行高精度单细胞RNA测序。我们还对5例患者的238个细胞进行了单细胞多组学测序。结果无监督聚类分析区分了所有肿瘤亚型,与基于免疫组化的分类一致,提供了额外的信息。我们鉴定了三种正常的内分泌细胞类型:生长激素细胞、乳激素细胞和促性腺激素细胞。肿瘤与配对正常细胞的比较显示,促性腺激素肿瘤的差异表达基因以下调为主,而生长激素和泌乳激素肿瘤的差异表达基因以上调为主。我们鉴定了新的肿瘤相关基因,如AMIGO2、ZFP36、BTG1和DLG5。表达多个激素基因的肿瘤表现出很少的转录组异质性。此外,单细胞多组学分析表明,该肿瘤具有相对均匀的基因组模式,拷贝数变异略有异质性。结论我们的单细胞转录组和单细胞多组学分析为这些复杂肿瘤的特征和异质性提供了新的见解,以确定生物标志物和治疗靶点。
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