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宿主免疫应答的多队列分析确定了与病毒无关的严重性相关的保守保护性和有害模块( Multi-cohort analysis of host immune response identifies conserved protective and detrimental modules associated with severity irrespective of virus )
H Zheng AM Rao D Dermadi J Toh P Khatri
新型冠状病毒大流行病是本十年来的第四次大流行病,它突出了全球大流行病防备工作的差距,并强调需要进行可概括的测试,以避免世界各地的卫生保健系统无论病毒如何都处于压倒性地位。我们整合了来自18个国家的34个独立队列中感染16种病毒之一的患者的4780份血液转录组谱,以及来自3个独立队列中264224个免疫细胞的71份scRNA-seq谱。我们发现与严重程度相关的髓系细胞主导的保守宿主反应。其表现为造血、骨髓生成和骨髓源性抑制细胞增多，严重程度增加。我们鉴定了四个基因模块，它们描绘了与轻度和重度结局相关的不同轨迹，并表明在严重病毒感染期间干扰素应答与保护性宿主应答是解耦的。这些模块以临床有用的准确性区分非重症和重症病毒感染。我们的发现为病毒感染期间的免疫反应动态提供了见解，并确定了可能影响患者结局的因素。
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