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上海肺炎克雷伯菌多药耐药的分子流行病学因素分析( Molecular epidemiologic factors contributing to quinolone resistance in clinical multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae isolates from Shanghai, China )
Y Wang G Cai J Zhang X Xu H Lu
背景肺炎克雷伯菌是免疫功能低下人群中常见的病原菌,其对喹诺酮类药物的耐药率不断上升,严重影响了该类药物的广泛应用。本研究旨在探讨上海地区多药耐药肺炎K.(MDR-KP)临床分离株对喹诺酮类药物耐药的主要原因。结果2017年1月至3月,在上海某教学医院进行细菌耐药性监测,共筛选出34株肺炎K菌,其中30株为耐碳青霉烯类肺炎K菌(CRKP)。两个主要高危CRKP克隆ST11-wzi64和ST15-WZI19/WZI24可能通过呼吸途径在重症监护室和/或神经外科引起三次点源性院内暴发,促进了多药耐药决定簇的共选择和进化。在ST15(S83F、D87A;S80I)、ST11(S83I、D87G;S80I)和ST218(D87A;S80I)中出现多个喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变。质粒介导的喹诺酮耐药决定簇qnrS1、aac(6 )-IB-CR、oqxAB在32株(94.1%)分离株中单独或联合表达,并伴有β-内酰胺酶(主要是KPC-2型碳青霉烯酶和CTX-M型超广谱β-内酰胺酶)、16S rRNA甲基酶(ArmA和RmtB)和腐胺ABC转运体渗透酶(PotI)变异,与QRDR突变无关。IS5-转座酶在ST11菌株中插入失活AcrR,即ACRB转录阻遏子。13个与ST(n=7)和WZI-等位基因(n=9)相关的ompK36变异体在系统发育树中聚类为10个亚谱系,可能影响多药耐药表型和感染结果。ST11、ST15和ST218的OmpK35位点发生移码突变,并在OmpK36位点134~135位点发生Gd插入,均表现出明显的OmpK36基因型微进化簇。7株喹诺酮类敏感菌株的孔蛋白基因保持完整,其中ST13-wzi74(碳青霉烯酶KPC-2和NDM-1-联产体)和ST65-WZI72各有2株CRKPs。结论在选择压力下,三种类型(QRDR、AcrR、OMPK36/OMPK35)突变的积累和耐药基因的获得一直是耐喹诺酮类药物临床分离株耐药的原因,加强了对这些分离株的进化和传播进行流行病学监测的重要性。我们的发现为进一步的感染控制和抗生素管理倡议提供了详细的机械分析和流行病学含义。
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